GenIDA : Plateforme participative internationale de recherche sur les troubles du développement intellectuel, avec ou sans autisme et épilepsie d’origine génétique
France, Australie, Canada...and 5 more
,
2016
GenIDA: International participatory platform for research into genetic forms of intellectual development disorders, with or without autism and epilepsy.
France, Australia, Canada...and 5 more
,
2016
Sommaire
- Présentation de l'étude
- Thématique
- Population de l'étude
- Pré-requis réglementaires
- Responsable scientifique
- Membre de l'équipe de recherche
- Points de contact
- Financeur
- Organisation et gouvernance
- Autre(s) identifiant(s) de l'étude
- Unité d'analyse
- Modèle d'étude
- Etude observationnelle
- Critères d'évaluation (de jugement)
- Collecte et réutilisation de données
- Accès aux données
- Documents connexes
Présentation de l'étude
Titre
de l'étude
GenIDA : Plateforme participative internationale de recherche sur les troubles du développement intellectuel, avec ou sans autisme et épilepsie d’origine génétique
Acronyme de l'étude
GenIDA
Statut actuel de l'étude
Étude en cours
Objectifs de l'étude
L'objectif principal de cette étude est de caractériser, à partir des données recueillies dans la base de données GenIDA, les manifestations cliniques, médicales, cognitives et comportementales ainsi que l'histoire naturelle des formes génétiques de déficience intellectuelle avec ou sans autisme et épilepsie.
Plus spécifiquement, cette étude vise à :
- constituer et renforcer des cohortes internationales de patients avec une anomalie génétique spécifique ;
- décrire le spectre phénotypique associé à chacune de ces anomalies génétiques ;
- identifier la fréquence et la diversité des comorbidités associées ;
- étudier l'évolution des manifestations cliniques et des compétences cognitives et comportementales au cours du temps, grâce à un recueil longitudinal des données ;
- mettre en évidence des manifestations potentiellement sous-estimées ou non encore décrites ;
- contribuer à l'amélioration de la prise en charge et du suivi médical des personnes concernées, en produisant des données utiles aux familles, aux cliniciens, aux généticiens et aux autres professionnels de santé.
L'objectif général est ainsi de transformer la collecte collaborative de données par les familles en connaissances nouvelles et médicalement significatives pour les maladies neurodéveloppementales génétiques rares.
Plus spécifiquement, cette étude vise à :
- constituer et renforcer des cohortes internationales de patients avec une anomalie génétique spécifique ;
- décrire le spectre phénotypique associé à chacune de ces anomalies génétiques ;
- identifier la fréquence et la diversité des comorbidités associées ;
- étudier l'évolution des manifestations cliniques et des compétences cognitives et comportementales au cours du temps, grâce à un recueil longitudinal des données ;
- mettre en évidence des manifestations potentiellement sous-estimées ou non encore décrites ;
- contribuer à l'amélioration de la prise en charge et du suivi médical des personnes concernées, en produisant des données utiles aux familles, aux cliniciens, aux généticiens et aux autres professionnels de santé.
L'objectif général est ainsi de transformer la collecte collaborative de données par les familles en connaissances nouvelles et médicalement significatives pour les maladies neurodéveloppementales génétiques rares.
Résumé de l'étude
La déficience intellectuelle (DI) concerne environ 2 à 3 % de la population. Plus de la moitié des cas seraient liés à une cause génétique, telle qu'une mutation dans un gène, une anomalie chromosomique ou une variation du nombre de copies (CNV). Les progrès du séquençage haut débit ont permis d'identifier plus de 1 800 gènes récurrents impliqués dans ces formes de DI/autisme. Malgré ces avancées, pour nombre de ces syndromes, les données cliniques, comportementales, médicales et d'histoire naturelle restent très limitées, en raison de leur rareté et du faible nombre de patients concernés.
C'est dans ce contexte qu'a été créé GenIDA, une base de données participative internationale visant à améliorer les connaissances sur ces formes génétiques de DI. Elle permet de collecter, de manière standardisée et longitudinale, des informations sur les manifestations cliniques et les comorbidités de personnes présentant une forme génétique de DI et/ou de TSA. Les données sont principalement renseignées par les familles à travers un questionnaire structuré disponible en 10 langues. Cette approche participative et multilingue facilite la mobilisation des familles à travers le monde, favorisant le recrutement.
L'analyse de ces données permet de regrouper les patients en cohortes par gène ou par syndrome, de taille suffisante pour mieux décrire les différents profils associés à chaque anomalie génétique. Elle permet notamment d'étudier la fréquence des manifestations cliniques et des comorbidités, leur âge d'apparition, leur sévérité et leur évolution au cours du temps.
C'est dans ce contexte qu'a été créé GenIDA, une base de données participative internationale visant à améliorer les connaissances sur ces formes génétiques de DI. Elle permet de collecter, de manière standardisée et longitudinale, des informations sur les manifestations cliniques et les comorbidités de personnes présentant une forme génétique de DI et/ou de TSA. Les données sont principalement renseignées par les familles à travers un questionnaire structuré disponible en 10 langues. Cette approche participative et multilingue facilite la mobilisation des familles à travers le monde, favorisant le recrutement.
L'analyse de ces données permet de regrouper les patients en cohortes par gène ou par syndrome, de taille suffisante pour mieux décrire les différents profils associés à chaque anomalie génétique. Elle permet notamment d'étudier la fréquence des manifestations cliniques et des comorbidités, leur âge d'apparition, leur sévérité et leur évolution au cours du temps.
Mots-clés libres
Maladie génétique Maladie rare Déficience intellectuelle Histoire naturelle Comorbidité Recherche participative Autisme TSA TDI épilepsie
Thématique
Spécialité(s) médicale(s) concernée(s)
Cardiologie et médecine vasculaire Dermatologie Endocrinologie Gastroentérologie Génétique médicale Hématologie Hépatologie Immunologie médicale Infectiologie Neurologie Nutrition et diététique Néphrologie Odontologie Oncologie Ophtalmologie Orthopédie et traumatologie Oto-rhino-laryngologie Pneumologie Psychiatrie Pédiatrie Rhumatologie
Pathologie(s), affection(s) ou diagnostic(s) ciblé(s) par l’étude
L'étude porte-t-elle sur une ou plusieures maladies rares ?
Oui
Population de l'étude
Type de population
Patients
Sexe
Féminin Masculin Autre
Âge
Nouveau-né (naissance à 28j) Nourrisson (28j à 2 ans) Petite enfance (2 à 5 ans) Enfance (6 à 12 ans) Adolescence (13 à 18 ans) Adulte (19 à 24 ans) Adulte (25 à 44 ans) Adulte (45 à 64 ans) Personne âgée (65 à 79 ans) Grand âge (80 ans et plus)
Critères d'inclusion
Il y a deux critères d'inclusion à respecter pour être inclus dans l'étude :
• Présenter un trouble du neurodéveloppement, avec ou sans autisme et/ou épilepsie
• Avoir été diagnostiqué comme porteur d’une anomalie génétique responsable de ce trouble
Critères d'exclusion
Il y a deux critères d'exclusion qui sont :
- De présenter une anomalie génétique classée comme « variant de signification incertaine » (VUS)
- L'absence de diagnostic génétique établi pour expliquer le trouble du neurodéveloppement.
- De présenter une anomalie génétique classée comme « variant de signification incertaine » (VUS)
- L'absence de diagnostic génétique établi pour expliquer le trouble du neurodéveloppement.
Pays concerné(s)
France Australie Canada Allemagne Pays-bas Espagne Royaume-uni Etats-unis
Région(s) française(s) concernée(s)
Auvergne Rhône-Alpes Bourgogne Franche-Comté Bretagne Centre-Val de Loire Corse Grand Est Guadeloupe Guyane Hauts-de-France Ile-de-France La Réunion Martinique Mayotte Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire Provence - Alpes - Côte d'Azur
Champ géographique, précisions
La liste des pays n'est pas exhaustive. Le caractère international du projet permet l’inclusion de participants et/ou de données provenant de différents pays et territoires, sans restriction géographique particulière.
Pré-requis réglementaires
-
Autorisation 1
-
-
Autorisation 2
-
Responsable scientifique
Responsable scientifique 1
Prénom du responsable scientifique
Jean-Louis
NOM du responsable scientifique
MANDEL
Email du responsable scientifique
jlmandel@igbmc.fr
ORCID du responsable scientifique
Nom de l'organisation d'affiliation principale
Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC)
Affiliation(s), précisions
Université de Strasbourg, CNRS UMR 7104 - Inserm U 1258
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Point(s) de contact
Point de contact 1
Prénom du contact
Jean-Louis
NOM du contact
MANDEL
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC)
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Université de Strasbourg, CNRS UMR 7104 - Inserm U 1258
Point de contact 2
Prénom du contact
María Victoria
NOM du contact
HINCKELMANN
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC)
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Université de Strasbourg, CNRS UMR 7104 - Inserm U 1258
Financeur
Financeur 1
Nom du financeur
UNIVERSITE DE STRASBOURG
Type de financeur
Public (France)
Identifiant du financeur
SIREN :
130005457
🗐
Financeur 2
Nom du financeur
Fondation Jérôme Lejeune
Type de financeur
Privé à but non lucratif
Financeur 3
Nom du financeur
Roche Pharma France
Type de financeur
Industrie
Financeur 4
Nom du financeur
GIS autisme et troubles du neurodéveloppement
Type de financeur
Public (France)
Financeur 5
Nom du financeur
Stras&ND
Type de financeur
Public (Europe)
Organisation et gouvernance
Promoteur 1
Nom du promoteur
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM)
Statut du promoteur
Public (France)
Identifiant du promoteur
SIREN:
180036048
🗐
Comité scientifique ou de pilotage
Oui
Comité, précisions
Le Conseil scientifique de GenIDA est composé d’une vingtaine de médecins et chercheurs internationalement reconnus provenant de plusieurs pays et avec une expertise dans les troubles du neurodéveloppement d’origine génétique, ainsi que des représentants d’associations de patients et de familles. Sa composition précise peut évoluer d’une année à l’autre, en fonction notamment de la disponibilité et de l’engagement des professionnels qui le composent.
Réseaux, consortiums
Oui
Collaboration(s) impliquée(s), précisions
GenIDA favorise le partage des données et la collaboration scientifique. L'équipe travaille en lien étroit avec des chercheurs, des professionnels de santé et des associations de familles dans plusieurs pays. Ces collaborations concernent différents domaines médicaux et différentes maladies rares. Elles permettent de développer des projets de recherche communs, ainsi que le partage de données cliniques et comportementales, de connaissances et d'expertise entre les partenaires. Le réseau de collaborateurs de GenIDA comprend, sans que cette liste soit exhaustive, D. Koolen (NL) ; C. Ockeloen (NL) ; A. Piton (FR) ; I. Fernandes Ulibarri, Association Kleefstra España (ES) ; T. Smol (FR) ; A. Morgan (AU) ; T. Zdolsek Draksler (SLO) ; E. Schaeffer (FR) ; A. Gregor (CH) ; F. Roper Conquer, MED13L France (FR) ; et P. Fenaux, UNAPEI (FR). Ce réseau évolue en fonction des besoins scientifiques et cliniques liés aux maladies étudiées dans GenIDA et reste ouvert à de nouvelles collaborations.
Autre(s) identifiant(s) de l'étude
| Type d'identifiant de l'étude | Identifiant de l'étude |
|---|---|
| ClinicalTrials.gov ID | NCT06871696 |
Unité de collecte
Unité de collecte
Individus
Modèle d'étude
Modèle d'étude
Etude observationnelle
Étude observationnelle
Modèle de l’étude observationnelle
Cohorte
Perspective temporelle
Longitudinale rétrospective
L'étude comporte-t-elle plusieurs groupes définis dès l'inclusion ?
Oui
Facteur, processus ou exposition étudié(e)
Facteur, processus ou exposition étudié 1
Nom du facteur ou de l'exposition
GenIDA collecte des caractéristiques physiques, médicales, comportementales et cognitives des troubles du neurodéveloppement d’origine génétique.
Type de facteur ou d'exposition
Autre
Autre type
Récolte des données cliniques des patients dans le cadre de leurs soins courants sans facteur ni exposition en particulier.
Critères d'évaluation (de jugement)
Critère d'évaluation (de jugement) principal
Fréquence et caractéristiques des manifestations cliniques, médicales, cognitives et comportementales rapportées chez les patients inclus dans les différentes cohortes GenIDA. Ces manifestations sont évaluées selon leur âge d'apparition, leur évolution et, lorsque cela est pertinent, leur sévérité.
Collecte et réutilisation de données
Nombre de participants
Nombre prévu de participants
[1000-10000[ individus
Nombre réel de participants
2524 participants
Chronologie de la collecte
Date de début de la collecte (recrutement du premier participant)
15/07/2016
Fréquence de la collecte
Collecte continue. Les données peuvent être renseignées à tout moment par les familles et proches, de manière autonome, via la plateforme GenIDA, accessible en permanence.
Procédure de collecte
Mode de collecte
Questionnaire auto-administré
Mode de collecte, précisions
Les données peuvent être renseignées à tout moment par les familles et proches, de manière autonome, via la plateforme GenIDA, accessible en permanence.
Procédure d’échantillonnage à l’inclusion
Non probabiliste Non probabiliste : disponibilité (de convenance ou d'opportunité) Autre
Source de recrutement des participants
Autre
Autre source de recrutement, précisions
Le recrutement est réalisé par l’intermédiaire des associations de patients et de familles, des professionnels de santé, ainsi que des réseaux de GenIDA et ses actions de communication et de sensibilisation.
Suivi actif des participants
Un suivi actif des participants est-il réalisé ?
Oui
Modalités du suivi actif
Autre
Autre modalité de suivi, précisions
Suivi par contact avec le participant par téléphone ou e-mail, de manière non-systématique. Ce suivi va dépendre de chaque cas particulier et des besoins du projet scientifique en cours.
Types de données
Type de données
Données de santé rapportées par les participants de l'étude
Réutilisation de données existantes
Informations concernant les données collectées auprès des participants dans le cadre de l'étude
Accès aux données
Disponibilité du jeu de données
Accès aux données individuelles
Accès réservé
Modalités de mise à disposition des données agrégées
Les données agrégées et anonymisées sont accessibles aux participants et aux professionnels inscrits sur GenIDA.
Outil de demande d'accès aux données
Existe-t-il un outil de demande d'accès aux données ?
Oui
Lien vers l'outil de demande d'accès
Conditions d’usage
Conditions d'accès aux données
Les données agrégées et anonymisées sont directement accessibles sur le site GenIDA. Elles sont disponibles pour les participants après avoir complété leur questionnaire en ligne, et pour les professionnels après validation de leur inscription. L’accès aux donnés individuelles anonymisées nécessite une demande spécifique, effectuée via le site GenIDA ou par email, et soumis à validation.
Restrictions d'accès
Les données peuvent être utilisées à des fins de recherche scientifique, dans le respect de la « User Data Charter » de GenIDA.
Personne à contacter pour des renseignements concernant les données
| First name LAST NAME of the contact | Email du contact |
|---|---|
| Victoria HINCKELMANN | genida@igbmc.fr |
| Jean-Louis MANDEL | jlmandel@igbmc.fr |
Obligations liées à l’usage des données
Obligation de transmission des travaux
Toute utilisation des données doit être signalée à GenIDA avant leur exploitation. Les utilisateurs sont invités à contacter GenIDA lors de la préparation de travaux ou d’articles scientifiques afin de préciser les modalités de collaboration et de crédit de GenIDA.
Obligation de citation
Toute publication, présentation ou communication scientifique utilisant des données ou des résultats issus de GenIDA doit citer GenIDA. Les modalités de citation et de crédit de GenIDA doivent être définies en concertation avec l’équipe GenIDA.
Dictionnaire des variables
Existe-t-il un dictionnaire des variables ?
Non
Un échantillon fictif du jeu de données est-il disponible ?
Non
Documents connexes
Document connexe 1
Type de document
Publication issue de l'étude et présentant les résultats de la recherche (articles, posters, rapports, ouvrages ou chapitres...)
Titre du document
Liste des publications de GenIDA et liens vers les articles scientifiques
Lien vers le document
Document connexe 2
Type de document
Publication définissant la base de données et/ou son protocole de collecte (article présentant les données, profil de la cohorte, article sur la méthode ou le protocole, article de synthèse, note sur les données, rapport enregistré...).
Titre du document
Liste des guides pour les familles et liens vers les documents
Lien vers le document
