Devenir à long terme de l’atrésie de l’œsophage : Profils transomiques à l’adolescence
France
,
2024 - 2026
Sommaire
- Présentation de l'étude
- Thématique
- Population de l'étude
- Pré-requis réglementaires
- Responsable scientifique
- Membre de l'équipe de recherche
- Points de contact
- Financeur
- Organisation et gouvernance
- Autre(s) identifiant(s) de l'étude
- Unité d'analyse
- Modèle d'étude
- Etude observationnelle
- Critères d'évaluation (de jugement)
- Collecte et réutilisation de données
- Accès aux données
- Documents connexes
Présentation de l'étude
Titre
de l'étude
Devenir à long terme de l’atrésie de l’œsophage : Profils transomiques à l’adolescence
Acronyme de l'étude
TransEAsome
Statut actuel de l'étude
Étude en cours
Objectifs de l'étude
2.1 Objectif principal
1. Evaluer la prévalence du reflux gastro œsophagien (RGO) [pH/impédance-métrie mettant en évidence un RGO pathologique et/ou si des lésions d’œsophagite peptique sont observées lors d’une endoscopie l’année précédant la visite ou si l’enfant présente des antécédents de RGO compliqué ayant conduit à une intervention anti-reflux] à l'adolescence (13-14 ans) chez les enfants nés avec une atrésie de l’œsophage
2.2 Objectifs secondaires
L’étude comporte plusieurs objectifs secondaires :
1. Identifier les facteurs mesurés tout au long du suivi du patient (naissance, 1 an, 6 ans et 13/14 ans) associés à la prévalence d’un RGO à l’adolescence chez les enfants nés avec une atrésie de l’œsophage
2. Évaluer à l’adolescence la qualité de vie, l’état nutritionnel et la fréquence des complications respiratoires chez les enfants nés avec une atrésie de l’œsophage
Chez les patients avec une biopsie de l’œsophage à 10-14 ans
3. Analyser les profils omiques et multi-omiques, issus des biopsies de l’œsophage, de ces patients à l'adolescence - en comparaison avec un groupe témoin d'adolescents sans AO - afin d'identifier les perturbations des voies biologiques dans l’atrésie de l’œsophage Chez les patients avec plusieurs biopsies depuis leur naissance
4. Etudier les changements de niveaux d’expression des variables omiques des voies biologiques identifiées dans OS3 au cours du temps
Chez les patients avec une prise de sang et une biopsie de l’œsophage à 10-14 ans (étude ancillaire dans les centres de Lille, Paris Necker, Paris Robert Debré, Lyon, Grenoble et Marseille)
5. Etudier la corrélation entre les niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines dans le plasma et ceux mesurés dans les biopsies œsophagiennes correspondant aux variables omiques identifiées dans OS3.
1. Evaluer la prévalence du reflux gastro œsophagien (RGO) [pH/impédance-métrie mettant en évidence un RGO pathologique et/ou si des lésions d’œsophagite peptique sont observées lors d’une endoscopie l’année précédant la visite ou si l’enfant présente des antécédents de RGO compliqué ayant conduit à une intervention anti-reflux] à l'adolescence (13-14 ans) chez les enfants nés avec une atrésie de l’œsophage
2.2 Objectifs secondaires
L’étude comporte plusieurs objectifs secondaires :
1. Identifier les facteurs mesurés tout au long du suivi du patient (naissance, 1 an, 6 ans et 13/14 ans) associés à la prévalence d’un RGO à l’adolescence chez les enfants nés avec une atrésie de l’œsophage
2. Évaluer à l’adolescence la qualité de vie, l’état nutritionnel et la fréquence des complications respiratoires chez les enfants nés avec une atrésie de l’œsophage
Chez les patients avec une biopsie de l’œsophage à 10-14 ans
3. Analyser les profils omiques et multi-omiques, issus des biopsies de l’œsophage, de ces patients à l'adolescence - en comparaison avec un groupe témoin d'adolescents sans AO - afin d'identifier les perturbations des voies biologiques dans l’atrésie de l’œsophage Chez les patients avec plusieurs biopsies depuis leur naissance
4. Etudier les changements de niveaux d’expression des variables omiques des voies biologiques identifiées dans OS3 au cours du temps
Chez les patients avec une prise de sang et une biopsie de l’œsophage à 10-14 ans (étude ancillaire dans les centres de Lille, Paris Necker, Paris Robert Debré, Lyon, Grenoble et Marseille)
5. Etudier la corrélation entre les niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines dans le plasma et ceux mesurés dans les biopsies œsophagiennes correspondant aux variables omiques identifiées dans OS3.
Résumé de l'étude
L'atrésie de l'œsophage (AO), une malformation de l'œsophage présente dès la naissance, se caractérise par l’interruption de la continuité de l’œsophage, qui se termine alors en cul-de-sac. Les aliments ou la salive ne peuvent pas être amenés dans l’estomac. Elle concerne 150 naissances par an en moyenne en France, ce qui en fait une maladie rare.
Il est alors nécessaire de réaliser une opération visant à remettre l’œsophage en continuité. Bien que cette intervention permette à la grande majorité des enfants de survivre à la période néonatale, il peut persister toute la vie des problèmes de santé tels que le reflux gastro-oesophagien, des difficultés pour manger, des problèmes respiratoires mais aussi de croissance.
Objectifs du projet
L’objectif du projet est de créer une cohorte prospective d’adolescents de 13/14 ans, nichée dans le registre national des AO. En complément des données cliniques, une biobanque d'échantillons de muqueuse œsophagienne et de plasma sera constituée.
Une fois les données cliniques collectées et les données omiques (issues de l’analyse des échantillons biologiques de la biobanque) générées, elles seront analysées par les partenaires du projet afin d’évaluer le devenir à long terme de l’AO et d’établir des profils multiomiques.
Il est alors nécessaire de réaliser une opération visant à remettre l’œsophage en continuité. Bien que cette intervention permette à la grande majorité des enfants de survivre à la période néonatale, il peut persister toute la vie des problèmes de santé tels que le reflux gastro-oesophagien, des difficultés pour manger, des problèmes respiratoires mais aussi de croissance.
Objectifs du projet
L’objectif du projet est de créer une cohorte prospective d’adolescents de 13/14 ans, nichée dans le registre national des AO. En complément des données cliniques, une biobanque d'échantillons de muqueuse œsophagienne et de plasma sera constituée.
Une fois les données cliniques collectées et les données omiques (issues de l’analyse des échantillons biologiques de la biobanque) générées, elles seront analysées par les partenaires du projet afin d’évaluer le devenir à long terme de l’AO et d’établir des profils multiomiques.
Mots-clés libres
atrésie de l'oesophage pédiatrie cohorte omique
Thématique
Spécialité(s) médicale(s) concernée(s)
Gastroentérologie Pédiatrie
Pathologie(s), affection(s) ou diagnostic(s) ciblé(s) par l’étude
Atrésie de l'œsophage Atrésie de l'œsophage sans fistule Atrésie de l'œsophage avec fistule trachéoœsophagienne Atrésie œsophagienne à long intervalle Atrésie de l'œsophage avec fistule œsophagobronchique Atrésie de l'œsophage avec fistule entre la trachée et la poche œsophagienne inférieure Atrésie de l'œsophage avec fistule entre la trachée et la poche œsophagienne supérieure Atrésie de l'œsophage avec fistule entrela trachée et poche œsophagienne
Déterminants de santé
Déterminants socio-démographiques et économiques Déterminants socio-démographiques et économiques : Genre Déterminants socio-démographiques et économiques : Âge Déterminants liés au système de santé Déterminants liés au système de santé : Consommation des soins Déterminants comportementaux Déterminants comportementaux : Activité physique Déterminants comportementaux : Hygiène Déterminants biologiques Déterminants biologiques : Sexe Autre
Autres déterminants, précisions
protéines, méthylation, micro-ARN
L'étude porte-t-elle sur une ou plusieures maladies rares ?
Oui
Population de l'étude
Type de population
Patients
Sexe
Féminin Masculin
Âge
Prénatal Nouveau-né (naissance à 28j) Nourrisson (28j à 2 ans) Enfance (6 à 12 ans) Adolescence (13 à 18 ans)
Critères d'inclusion
Pour le groupe AO :
- Né avec une atrésie de l’œsophage (AO) en France ou dans les DOM/TOM
- Anastomose œsophagienne réalisée
- Âgé de 13 ou 14 ans durant la période de recrutement (2023/2026)
- Participation au registre ReNAtO
- Patient assuré social
- Patient disposé à se conformer à toutes les procédures de l’étude et à sa durée
Pour la sous-étude sang :
- Endoscopie digestive haute réalisée dans le cadre du soin entre 10 et 14 ans avec prélèvement de biopsie de muqueuse œsophagienne
- Patient ayant donné son consentement écrit pour participer à l’étude (voire à l’étude ancillaire le cas échéant pour les centres de Lille, Paris Necker, Paris Robert Debré, Lyon, Marseille et Grenoble)
Pour le groupe témoin :
- Endoscopie digestive haute réalisée entre 10 et 14 ans avec prélèvement de biopsie de muqueuse œsophagienne
- Endoscopie digestive haute réalisée dans le cadre du soin pour des signes digestifs chroniques ou aigus pour éliminer une étiologie organique (œsophagite peptique, œsophagite gastrique, œsophagite à éosinophiles
ou ulcère)
- Endoscopie et histologie normales
- Aucune maladie chronique concomitante évolutive
Critères d'exclusion
Critères de non inclusion
Pour le groupe AO :
- Participation concomitante à un essai interventionnel ainsi que dans les 3
mois précédant l’inclusion
- Parents refusant la participation à l’étude
Pour le groupe témoin :
- Biopsie de l’œsophage histologiquement non normale
- Parents refusant la participation à l’étude
- Enfant ayant une pathologie organique connue
Pour le groupe AO :
- Participation concomitante à un essai interventionnel ainsi que dans les 3
mois précédant l’inclusion
- Parents refusant la participation à l’étude
Pour le groupe témoin :
- Biopsie de l’œsophage histologiquement non normale
- Parents refusant la participation à l’étude
- Enfant ayant une pathologie organique connue
Pays concerné(s)
France
Région(s) française(s) concernée(s)
Auvergne Rhône-Alpes Bourgogne Franche-Comté Bretagne Centre-Val de Loire Corse Grand Est Guadeloupe Hauts-de-France Ile-de-France La Réunion Martinique Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire Provence - Alpes - Côte d'Azur
Pré-requis réglementaires
-
Autorisation 1
-
-
Autorisation 2
-
Responsable scientifique
Responsable scientifique 1
Prénom du responsable scientifique
Frédéric
NOM du responsable scientifique
GOTTRAND
Email du responsable scientifique
frederic.gottrand@chu-lille.fr
ORCID du responsable scientifique
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE LILLE (CHU)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
265906719
🗐
Affiliation(s), précisions
Service de gastroentérologie, hépatologie et nutrition pédiatrique
Centre de référence des maladies chroniques et malformations de l'oesophage (CRACMO)
Centre de référence des maladies chroniques et malformations de l'oesophage (CRACMO)
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Membre de l'équipe de recherche
Responsable de l'équipe partenaire 1
Prénom du membre de l'équipe
Martin
NOM du membre de l'équipe
FIGEAC
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Affiliation(s), précisions
Plateformes Lilloises de Biologie Santé
Go@L
Go@L
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Responsable de l'équipe partenaire 2
Prénom du membre de l'équipe
Michel
NOM du membre de l'équipe
SALZET
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
180036048
🗐
Affiliation(s), précisions
INSERM Nord Ouest
PRISM
PRISM
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Responsable de l'équipe partenaire 3
Prénom du membre de l'équipe
Jimmy
NOM du membre de l'équipe
VANDEL
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Affiliation(s), précisions
Plateformes Lilloises de Biologie Santé
BiLille
BiLille
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Responsable de l'équipe partenaire 4
Prénom du membre de l'équipe
Régis
NOM du membre de l'équipe
HANKARD
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE D ORLEANS (CHUO)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
264500091
🗐
Affiliation(s), précisions
Kids France
Point(s) de contact
Point de contact 1
Prénom du contact
Mélanie
NOM du contact
LEROY
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE LILLE (CHU)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
265906719
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Service de gastroentérologie, hépatologie et nutrition pédiatrique
Centre de référence des maladies chroniques et malformations de l'oesophage (CRACMO)
Centre de référence des maladies chroniques et malformations de l'oesophage (CRACMO)
Point de contact 2
Prénom du contact
Martin
NOM du contact
FIGEAC
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Plateformes Lilloises de Biologie Santé
Go@L
Go@L
Point de contact 3
Prénom du contact
Michel
NOM du contact
SALZET
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
180036048
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
INSERM Nord Ouest
PRISM
PRISM
Point de contact 4
Prénom du contact
Jimmy
NOM du contact
VANDEL
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Plateformes Lilloises de Biologie Santé
BiLille
BiLille
Point de contact 5
Prénom du contact
Régis
NOM du contact
HANKARD
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE D ORLEANS (CHUO)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
264500091
🗐
Affiliation(s), précisions
Kids France
Financeur
Financeur 1
Nom du financeur
AGENCE NATIONALE DE LA RECHERCHE (ANR)
Type de financeur
Public (France)
Identifiant du financeur
SIREN :
130002504
🗐
Organisation et gouvernance
Promoteur 1
Nom du promoteur
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE LILLE (CHU)
Statut du promoteur
Public (France)
Identifiant du promoteur
SIREN:
265906719
🗐
Comité scientifique ou de pilotage
Oui
Comité, précisions
Comité de pilotage, et Scientifique Advisory Board
Réseaux, consortiums
Oui
Collaboration(s) impliquée(s), précisions
le réseau CRACMO
Unité de collecte
Unité de collecte
Individus
Modèle d'étude
Modèle d'étude
Etude observationnelle
Étude observationnelle
Modèle de l’étude observationnelle
Cohorte
Perspective temporelle
Autre
L'étude comporte-t-elle plusieurs groupes définis dès l'inclusion ?
Oui
Groupes à l'inclusion
Groupe à l'inclusion 1
Nom du groupe
Patient
Groupe à l'inclusion 2
Nom du groupe
Témoin
Facteur, processus ou exposition étudié(e)
Facteur, processus ou exposition étudié 1
Nom du facteur ou de l'exposition
Aucun
Critères d'évaluation (de jugement)
Critère d'évaluation (de jugement) principal
Le RGO sera suspecté devant des signes évocateurs tels que des régurgitations et du pyrosis. Il sera confirmé si dans l’année précédant la visite, une pH/impédance-métrie met en évidence un RGO pathologique et/ou si des lésions d’œsophagite peptique sont observées lors d’une endoscopie ou si l’enfant présente des antécédents de RGO compliqué ayant conduit à une intervention anti-reflux. Le RGO sera considéré comme absent en l’absence de signe clinique de RGO (régurgitations, pyrosis) et si la dernière pH/impédancemétrie réalisée sans traitement dans le cadre du suivi ne met pas en évidence un RGO pathologique.
Critère(s) d'évaluation (de jugement) secondaire(s)
OS n°1 :
Variable à expliquer (dépendante) : la prévalence d’un RGO à 13-14 ans
Variables explicatives (indépendantes) : elles seront déterminées parmi les caractéristiques des patients à la naissance, 1 an, 6 ans et 13-14 ans (données anténatales, signes vitaux, présence de malformation associées, type de l’atrésie, actes chirurgicaux réalisés, complications chirurgicales / digestives / respiratoires / neuro-orthopédiques, type d’alimentation et la scolarité).
OS n°2 :
- La qualité de vie des patients à l’âge d’adolescent sera évaluée par la passation à l’âge de 13-14 ans des échelles de qualité de vie suivantes : PedsQL et EA-QoL à la fois par le patient mais aussi par un parent. Les scores des échelles seront calculés conformément aux consignes de passation des auteurs.
- L’état nutritionnel sera évalué grâce au poids et à la taille ainsi qu’au calcul du z-score poids/taille et z-score IMC avec les courbes de croissance de l’organisation mondiale de la santé comme référence.
- Fréquence des complications respiratoires, évaluées lors de l’examen clinique (toux rauque lors des infections, une toux chronique, un asthme, une manifestation d’effort (toux, dyspnée), une atopie, un wheezing et/ou un stridor/cornage).
OS n°3
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Variables à expliquer (dépendantes) : diagnostic d’AO (oui/non)
Les voies métaboliques impactées seront obtenues par analyse d’enrichissement à partir des marqueurs dérégulés entre le groupe avec AO et le groupe sans AO.
OS n°4 :
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Etude de la différence de moyennes entre les niveaux des variables mesurées à différents temps
OS n°5 :
Variables mesurées dans le plasma : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines
Variables mesurées dans les biopsies œsophagiennes : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines L’unité statistique sera la variable omique (micro ARN ou protéine), la corrélation sera calculée entre les mesures dans le plasma et celles correspondantes dans les biopsies.
Variable à expliquer (dépendante) : la prévalence d’un RGO à 13-14 ans
Variables explicatives (indépendantes) : elles seront déterminées parmi les caractéristiques des patients à la naissance, 1 an, 6 ans et 13-14 ans (données anténatales, signes vitaux, présence de malformation associées, type de l’atrésie, actes chirurgicaux réalisés, complications chirurgicales / digestives / respiratoires / neuro-orthopédiques, type d’alimentation et la scolarité).
OS n°2 :
- La qualité de vie des patients à l’âge d’adolescent sera évaluée par la passation à l’âge de 13-14 ans des échelles de qualité de vie suivantes : PedsQL et EA-QoL à la fois par le patient mais aussi par un parent. Les scores des échelles seront calculés conformément aux consignes de passation des auteurs.
- L’état nutritionnel sera évalué grâce au poids et à la taille ainsi qu’au calcul du z-score poids/taille et z-score IMC avec les courbes de croissance de l’organisation mondiale de la santé comme référence.
- Fréquence des complications respiratoires, évaluées lors de l’examen clinique (toux rauque lors des infections, une toux chronique, un asthme, une manifestation d’effort (toux, dyspnée), une atopie, un wheezing et/ou un stridor/cornage).
OS n°3
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Variables à expliquer (dépendantes) : diagnostic d’AO (oui/non)
Les voies métaboliques impactées seront obtenues par analyse d’enrichissement à partir des marqueurs dérégulés entre le groupe avec AO et le groupe sans AO.
OS n°4 :
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Etude de la différence de moyennes entre les niveaux des variables mesurées à différents temps
OS n°5 :
Variables mesurées dans le plasma : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines
Variables mesurées dans les biopsies œsophagiennes : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines L’unité statistique sera la variable omique (micro ARN ou protéine), la corrélation sera calculée entre les mesures dans le plasma et celles correspondantes dans les biopsies.
Collecte et réutilisation de données
Nombre de participants
Nombre prévu de participants
< 500 individus
Nombre réel de participants
413
Chronologie de la collecte
Date de début de la collecte (recrutement du premier participant)
30/08/2024
Date de fin de la collecte (dernier suivi du dernier participant)
10/10/2026
Fréquence de la collecte
Une fois
Procédure de collecte
Mode de collecte
Entretien avec le participant (dont clinique) Examens et tests Mesures physiques/biologiques (tension artérielle, poids, biochimie, imagerie...) Tests psychologiques/échelles cliniques (dépression, cognition, qualité de vie...) Observation (clinique ou comportementale) Questionnaire auto-administré
Mode de collecte, précisions
Le projet TransEAsome est une cohorte nichée dans le registre ReNAtO (registre national des patients nés avec une atrésie de l'oesophage). Les données collectées dans TransEAsome sont couplées aux données du registre (naissance et 1 an).
Procédure d’échantillonnage à l’inclusion
Dénombrement complet (dont recrutement consécutif)
Source de recrutement des participants
Registre de maladies, de décès
Suivi actif des participants
Un suivi actif des participants est-il réalisé ?
Non
Types de données
Type de données
Données cliniques Données biologiques Données socio-démographiques Données économiques Autre
Autre type de données, précisions
qualité de vie
Données cliniques, précisions
présentation gastro, pneumo, neuro ortho, orthophonie
Données biologiques, précisions
omiques
Réutilisation de données existantes
Informations concernant les données collectées auprès des participants dans le cadre de l'étude
Source 1
Description de la source
Registre National des patients nés vivants avec une atrésie de l'oesophage en France
Identifiant de la source
ReNAtO
Type de source
Registre
Objectif de l'intégration de la source
Enrichissement des données par croisement (autre que le suivi passif)
Accès aux données
Disponibilité du jeu de données
Accès aux données individuelles
A définir
Conditions d’usage
Personne à contacter pour des renseignements concernant les données
| First name LAST NAME of the contact | Email du contact |
|---|---|
| Mélanie LEROY | melanie.leroy@chu-lille.fr |
Dictionnaire des variables
Existe-t-il un dictionnaire des variables ?
Oui
Documents connexes
Document connexe 1
Type de document
Publication définissant la base de données et/ou son protocole de collecte (article présentant les données, profil de la cohorte, article sur la méthode ou le protocole, article de synthèse, note sur les données, rapport enregistré...).
Titre du document
Long-term outcome of oesophageal atresia in adolescence (TransEAsome): a national French cohort study protocol
Lien vers le document
