Devenir à long terme de l’atrésie de l’œsophage : Profils transomiques à l’adolescence
France
,
2024 - 2026
Summary
- Présentation de l'étude
- Thématique
- Population de l'étude
- Pré-requis réglementaires
- Responsable scientifique
- Membre de l'équipe de recherche
- Points de contact
- Financeur
- Organisation et gouvernance
- Autre(s) identifiant(s) de l'étude
- Unité d'analyse
- Modèle d'étude
- Etude observationnelle
- Critères d'évaluation (de jugement)
- Collecte et réutilisation de données
- Accès aux données
- Documents connexes
Présentation de l'étude
Titre
de l'étude
Long-Term Outcomes of Esophageal Atresia: Transomic Profiles in Adolescence
Acronyme de l'étude
TransEAsome
Statut actuel de l'étude
Ongoing study
Objectifs de l'étude
2.1 Main Objective
1. Assess the prevalence of gastroesophageal reflux (GERD) [pH/impedance monitoring indicating pathological GERD and/or if lesions of peptic esophagitis are observed during an endoscopy in the year prior to the visit, or if the child has a history of complicated GERD that led to anti-reflux surgery] during adolescence (ages 13–14) in children born with esophageal atresia
2.2 Secondary Objectives
The study has several secondary objectives:
1. Identify the factors measured throughout the patient’s follow-up (at birth, 1 year, 6 years, and 13–14 years) that are associated with the prevalence of GERD in adolescence among children born with esophageal atresia
2. Assessing quality of life, nutritional status, and the frequency of respiratory complications in adolescents who were born with esophageal atresia
In patients who underwent an esophageal biopsy at ages 10–14
3. Analyze the omic and multi-omic profiles derived from esophageal biopsies in these patients during adolescence—in comparison with a control group of adolescents without esophageal atresia—to identify disruptions in biological pathways associated with esophageal atresia in patients who have had multiple biopsies since birth
4. Examine changes in the expression levels of omic variables in the biological pathways identified in OS3 over time
Among patients who underwent blood tests and esophageal biopsies at ages 10–14 (a substudy conducted at centers in Lille, Paris Necker, Paris Robert Debré, Lyon, Grenoble, and Marseille)
5. To investigate the correlation between plasma levels of microRNAs or proteins and those measured in esophageal biopsies in relation to the omics variables identified in OS3.
1. Assess the prevalence of gastroesophageal reflux (GERD) [pH/impedance monitoring indicating pathological GERD and/or if lesions of peptic esophagitis are observed during an endoscopy in the year prior to the visit, or if the child has a history of complicated GERD that led to anti-reflux surgery] during adolescence (ages 13–14) in children born with esophageal atresia
2.2 Secondary Objectives
The study has several secondary objectives:
1. Identify the factors measured throughout the patient’s follow-up (at birth, 1 year, 6 years, and 13–14 years) that are associated with the prevalence of GERD in adolescence among children born with esophageal atresia
2. Assessing quality of life, nutritional status, and the frequency of respiratory complications in adolescents who were born with esophageal atresia
In patients who underwent an esophageal biopsy at ages 10–14
3. Analyze the omic and multi-omic profiles derived from esophageal biopsies in these patients during adolescence—in comparison with a control group of adolescents without esophageal atresia—to identify disruptions in biological pathways associated with esophageal atresia in patients who have had multiple biopsies since birth
4. Examine changes in the expression levels of omic variables in the biological pathways identified in OS3 over time
Among patients who underwent blood tests and esophageal biopsies at ages 10–14 (a substudy conducted at centers in Lille, Paris Necker, Paris Robert Debré, Lyon, Grenoble, and Marseille)
5. To investigate the correlation between plasma levels of microRNAs or proteins and those measured in esophageal biopsies in relation to the omics variables identified in OS3.
Résumé de l'étude
Esophageal atresia (EA), a congenital malformation of the esophagus present at birth, is characterized by a disruption in the continuity of the esophagus, which ends in a blind pouch. Food or saliva cannot pass into the stomach. It affects an average of 150 births per year in France, making it a rare condition.
It is therefore necessary to perform surgery to restore continuity of the esophagus. Although this procedure allows the vast majority of children to survive the neonatal period, health problems such as gastroesophageal reflux, difficulty eating, respiratory problems, and growth issues may persist throughout their lives.
Project Objectives
The goal of the project is to establish a prospective cohort of 13- and 14-year-old adolescents, nested within the national esophageal atresia registry. In addition to clinical data, a biobank of esophageal mucosal and plasma samples will be established.
Once the clinical data have been collected and the omics data (derived from the analysis of biological samples from the biobank) have been generated, they will be analyzed by the project partners to assess the long-term course of EA and establish multi-omics profiles.
It is therefore necessary to perform surgery to restore continuity of the esophagus. Although this procedure allows the vast majority of children to survive the neonatal period, health problems such as gastroesophageal reflux, difficulty eating, respiratory problems, and growth issues may persist throughout their lives.
Project Objectives
The goal of the project is to establish a prospective cohort of 13- and 14-year-old adolescents, nested within the national esophageal atresia registry. In addition to clinical data, a biobank of esophageal mucosal and plasma samples will be established.
Once the clinical data have been collected and the omics data (derived from the analysis of biological samples from the biobank) have been generated, they will be analyzed by the project partners to assess the long-term course of EA and establish multi-omics profiles.
Mots-clés libres
esophageal atresia pediatrics cohort omic
Thématique
Medical speciality/specialities represented
Gastroenterology Paediatrics
Pathology(ies), condition(s) or diagnose(s) targeted by the study
Atresia of oesophagus Atresia of oesophagus without fistula Atresia of oesophagus with tracheo-oesophageal fistula Long gap oesophageal atresia Atresia of oesophagus with oesophagobronchial fistula Atresia of oesophagus with fistula between trachea and lower oesophageal pouch Atresia of oesophagus with fistula between trachea and upper oesophageal pouch Atresia of oesophagus with fistula between trachea and oesophageal pouch
Health determinants
Socio-demographic and economic determinants Socio-demographic and economic determinants: Gender Socio-demographic and economic determinants: Age Healthcare system determinants Healthcare system determinants: Use of care Behavioral determinants Behavioral determinants: Physical activity Behavioral determinants: Hygiene Biological determinants Biological determinants: Sex Other
Other determinants, details
proteins, methylation, microRNA
L'étude porte-t-elle sur une ou plusieures maladies rares ?
Yes
Population de l'étude
Type de population
Patients population
Sexe
Female Male
Âge
Prenatal Infant Newborn (birth to 28 days) Infant (28 days to 2 years) Child (6 to 12 years) Adolescent (13 to 18 years)
Critères d'inclusion
For the EA group:
- Born with esophageal atresia (EA) in France or in the French overseas departments and territories (DOM/TOM)
- Esophageal anastomosis performed
- Must be 13 or 14 years old during the recruitment period (2023–2026)
- Enrollment in the Renato Registry
- Patient covered by social security
- A patient willing to comply with all study procedures and to participate for the duration of the study
For the blood substudy:
- Upper gastrointestinal endoscopy performed as part of medical care between the ages of 10 and 14, with a biopsy of the esophageal mucosa
- Patient who has provided written consent to participate in the study (or in the ancillary study, if applicable, for the centers in Lille, Paris Necker, Paris Robert Debré, Lyon, Marseille, and Grenoble)
For the control group:
- Upper gastrointestinal endoscopy performed between the ages of 10 and 14, with a biopsy of the esophageal mucosa
- Upper gastrointestinal endoscopy performed as part of the management of chronic or acute gastrointestinal symptoms to rule out an organic cause (peptic esophagitis, gastric esophagitis, eosinophilic esophagitis or ulcer)
- Normal endoscopy and histology
- No concurrent progressive chronic disease
Critères d'exclusion
Exclusion Criteria
For the EA group:
- Concurrent participation in an interventional trial as well as within 3
the month prior to inclusion
- Parents who refuse to participate in the study
For the control group:
- Esophageal biopsy with histologically abnormal findings
- Parents who refuse to participate in the study
- Child with a known organic condition
For the EA group:
- Concurrent participation in an interventional trial as well as within 3
the month prior to inclusion
- Parents who refuse to participate in the study
For the control group:
- Esophageal biopsy with histologically abnormal findings
- Parents who refuse to participate in the study
- Child with a known organic condition
Pays concerné(s)
France
Région(s) française(s) concernée(s)
Auvergne Rhône-Alpes Bourgogne Franche-Comté Bretagne Centre-Val de Loire Corse Grand Est Guadeloupe Hauts-de-France Ile-de-France La Réunion Martinique Normandie Nouvelle-Aquitaine Occitanie Pays de la Loire Provence - Alpes - Côte d'Azur
Pré-requis réglementaires
-
Autorisation 1
-
-
Autorisation 2
-
Responsable scientifique
Responsable scientifique 1
Prénom du responsable scientifique
Frédéric
NOM du responsable scientifique
GOTTRAND
Email du responsable scientifique
frederic.gottrand@chu-lille.fr
ORCID du responsable scientifique
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE LILLE (CHU)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
265906719
🗐
Affiliation(s), précisions
Department of Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition
Reference Center for Chronic Diseases and Esophageal Malformations (CRACMO)
Reference Center for Chronic Diseases and Esophageal Malformations (CRACMO)
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Membre de l'équipe de recherche
Responsable de l'équipe partenaire 1
Prénom du membre de l'équipe
Martin
NOM du membre de l'équipe
FIGEAC
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Affiliation(s), précisions
Lille-Based Biology and Health Platforms
Go@L
Go@L
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Responsable de l'équipe partenaire 2
Prénom du membre de l'équipe
Michel
NOM du membre de l'équipe
SALZET
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
180036048
🗐
Affiliation(s), précisions
INSERM Northwest
PRISM
PRISM
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Responsable de l'équipe partenaire 3
Prénom du membre de l'équipe
Jimmy
NOM du membre de l'équipe
VANDEL
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Affiliation(s), précisions
Lille Biology and Health Platforms
BiLille
BiLille
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Responsable de l'équipe partenaire 4
Prénom du membre de l'équipe
Régis
NOM du membre de l'équipe
HANKARD
ORCID du responsable de l'équipe
Identifiant IdRef
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE D ORLEANS (CHUO)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
264500091
🗐
Affiliation(s), précisions
Kids France
Point(s) de contact
Point de contact 1
Prénom du contact
Mélanie
NOM du contact
LEROY
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE LILLE (CHU)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
265906719
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Department of Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition / Reference Center for Chronic Diseases and Esophageal Malformations (CRACMO)
Point de contact 2
Prénom du contact
Martin
NOM du contact
FIGEAC
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Plateformes Lilloises de Biologie Santé
Go@L
Go@L
Point de contact 3
Prénom du contact
Michel
NOM du contact
SALZET
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
180036048
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
INSERM Nord Ouest
PRISM
PRISM
Point de contact 4
Prénom du contact
Jimmy
NOM du contact
VANDEL
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
UNIVERSITE DE LILLE
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
130029754
🗐
Identifiant RNSR du laboratoire d'appartenance
Affiliation(s), précisions
Plateformes Lilloises de Biologie Santé
BiLille
BiLille
Point de contact 5
Prénom du contact
Régis
NOM du contact
HANKARD
Email du contact
Nom de l'organisation d'affiliation principale
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE D ORLEANS (CHUO)
Identifiant de l'organisation d'affiliation principale
SIREN:
264500091
🗐
Affiliation(s), précisions
Kids France
Financeur
Financeur 1
Nom du financeur
AGENCE NATIONALE DE LA RECHERCHE (ANR)
Type de financeur
Public (France)
Identifiant du financeur
SIREN :
130002504
🗐
Organisation et gouvernance
Promoteur 1
Nom du promoteur
CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE LILLE (CHU)
Statut du promoteur
Public (France)
Identifiant du promoteur
SIREN:
265906719
🗐
Comité scientifique ou de pilotage
Oui
Comité, précisions
Comité de pilotage, et Scientifique Advisory Board
Réseaux, consortiums
Oui
Collaboration(s) impliquée(s), précisions
le réseau CRACMO
Unité de collecte
Unité de collecte
Individus
Modèle d'étude
Modèle d'étude
Etude observationnelle
Étude observationnelle
Modèle de l’étude observationnelle
Cohorte
Perspective temporelle
Autre
L'étude comporte-t-elle plusieurs groupes définis dès l'inclusion ?
Oui
Groupes à l'inclusion
Groupe à l'inclusion 1
Nom du groupe
Patient
Groupe à l'inclusion 2
Nom du groupe
Témoin
Facteur, processus ou exposition étudié(e)
Facteur, processus ou exposition étudié 1
Nom du facteur ou de l'exposition
Aucun
Critères d'évaluation (de jugement)
Critère d'évaluation (de jugement) principal
Le RGO sera suspecté devant des signes évocateurs tels que des régurgitations et du pyrosis. Il sera confirmé si dans l’année précédant la visite, une pH/impédance-métrie met en évidence un RGO pathologique et/ou si des lésions d’œsophagite peptique sont observées lors d’une endoscopie ou si l’enfant présente des antécédents de RGO compliqué ayant conduit à une intervention anti-reflux. Le RGO sera considéré comme absent en l’absence de signe clinique de RGO (régurgitations, pyrosis) et si la dernière pH/impédancemétrie réalisée sans traitement dans le cadre du suivi ne met pas en évidence un RGO pathologique.
Critère(s) d'évaluation (de jugement) secondaire(s)
OS n°1 :
Variable à expliquer (dépendante) : la prévalence d’un RGO à 13-14 ans
Variables explicatives (indépendantes) : elles seront déterminées parmi les caractéristiques des patients à la naissance, 1 an, 6 ans et 13-14 ans (données anténatales, signes vitaux, présence de malformation associées, type de l’atrésie, actes chirurgicaux réalisés, complications chirurgicales / digestives / respiratoires / neuro-orthopédiques, type d’alimentation et la scolarité).
OS n°2 :
- La qualité de vie des patients à l’âge d’adolescent sera évaluée par la passation à l’âge de 13-14 ans des échelles de qualité de vie suivantes : PedsQL et EA-QoL à la fois par le patient mais aussi par un parent. Les scores des échelles seront calculés conformément aux consignes de passation des auteurs.
- L’état nutritionnel sera évalué grâce au poids et à la taille ainsi qu’au calcul du z-score poids/taille et z-score IMC avec les courbes de croissance de l’organisation mondiale de la santé comme référence.
- Fréquence des complications respiratoires, évaluées lors de l’examen clinique (toux rauque lors des infections, une toux chronique, un asthme, une manifestation d’effort (toux, dyspnée), une atopie, un wheezing et/ou un stridor/cornage).
OS n°3
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Variables à expliquer (dépendantes) : diagnostic d’AO (oui/non)
Les voies métaboliques impactées seront obtenues par analyse d’enrichissement à partir des marqueurs dérégulés entre le groupe avec AO et le groupe sans AO.
OS n°4 :
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Etude de la différence de moyennes entre les niveaux des variables mesurées à différents temps
OS n°5 :
Variables mesurées dans le plasma : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines
Variables mesurées dans les biopsies œsophagiennes : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines L’unité statistique sera la variable omique (micro ARN ou protéine), la corrélation sera calculée entre les mesures dans le plasma et celles correspondantes dans les biopsies.
Variable à expliquer (dépendante) : la prévalence d’un RGO à 13-14 ans
Variables explicatives (indépendantes) : elles seront déterminées parmi les caractéristiques des patients à la naissance, 1 an, 6 ans et 13-14 ans (données anténatales, signes vitaux, présence de malformation associées, type de l’atrésie, actes chirurgicaux réalisés, complications chirurgicales / digestives / respiratoires / neuro-orthopédiques, type d’alimentation et la scolarité).
OS n°2 :
- La qualité de vie des patients à l’âge d’adolescent sera évaluée par la passation à l’âge de 13-14 ans des échelles de qualité de vie suivantes : PedsQL et EA-QoL à la fois par le patient mais aussi par un parent. Les scores des échelles seront calculés conformément aux consignes de passation des auteurs.
- L’état nutritionnel sera évalué grâce au poids et à la taille ainsi qu’au calcul du z-score poids/taille et z-score IMC avec les courbes de croissance de l’organisation mondiale de la santé comme référence.
- Fréquence des complications respiratoires, évaluées lors de l’examen clinique (toux rauque lors des infections, une toux chronique, un asthme, une manifestation d’effort (toux, dyspnée), une atopie, un wheezing et/ou un stridor/cornage).
OS n°3
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Variables à expliquer (dépendantes) : diagnostic d’AO (oui/non)
Les voies métaboliques impactées seront obtenues par analyse d’enrichissement à partir des marqueurs dérégulés entre le groupe avec AO et le groupe sans AO.
OS n°4 :
Variables mesurées : transcrits, métabolites, protéines et méthylation
Etude de la différence de moyennes entre les niveaux des variables mesurées à différents temps
OS n°5 :
Variables mesurées dans le plasma : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines
Variables mesurées dans les biopsies œsophagiennes : niveaux d’expression des micro ARN ou des protéines L’unité statistique sera la variable omique (micro ARN ou protéine), la corrélation sera calculée entre les mesures dans le plasma et celles correspondantes dans les biopsies.
Collecte et réutilisation de données
Nombre de participants
Nombre prévu de participants
< 500 individus
Nombre réel de participants
413
Chronologie de la collecte
Date de début de la collecte (recrutement du premier participant)
30/08/2024
Date de fin de la collecte (dernier suivi du dernier participant)
10/10/2026
Fréquence de la collecte
Une fois
Procédure de collecte
Mode de collecte
Entretien avec le participant (dont clinique) Examens et tests Mesures physiques/biologiques (tension artérielle, poids, biochimie, imagerie...) Tests psychologiques/échelles cliniques (dépression, cognition, qualité de vie...) Observation (clinique ou comportementale) Questionnaire auto-administré
Mode de collecte, précisions
Le projet TransEAsome est une cohorte nichée dans le registre ReNAtO (registre national des patients nés avec une atrésie de l'oesophage). Les données collectées dans TransEAsome sont couplées aux données du registre (naissance et 1 an).
Procédure d’échantillonnage à l’inclusion
Dénombrement complet (dont recrutement consécutif)
Source de recrutement des participants
Registre de maladies, de décès
Suivi actif des participants
Un suivi actif des participants est-il réalisé ?
Non
Types de données
Type de données
Données cliniques Données biologiques Données socio-démographiques Données économiques Autre
Autre type de données, précisions
qualité de vie
Données cliniques, précisions
présentation gastro, pneumo, neuro ortho, orthophonie
Données biologiques, précisions
omiques
Réutilisation de données existantes
Informations concernant les données collectées auprès des participants dans le cadre de l'étude
Source 1
Description de la source
Registre National des patients nés vivants avec une atrésie de l'oesophage en France
Identifiant de la source
ReNAtO
Type de source
Registre
Objectif de l'intégration de la source
Enrichissement des données par croisement (autre que le suivi passif)
Accès aux données
Disponibilité du jeu de données
Accès aux données individuelles
A définir
Conditions d’usage
Personne à contacter pour des renseignements concernant les données
| First name LAST NAME of the contact | Email du contact |
|---|---|
| Mélanie LEROY | melanie.leroy@chu-lille.fr |
Dictionnaire des variables
Existe-t-il un dictionnaire des variables ?
Oui
Documents connexes
Document connexe 1
Type de document
Publication définissant la base de données et/ou son protocole de collecte (article présentant les données, profil de la cohorte, article sur la méthode ou le protocole, article de synthèse, note sur les données, rapport enregistré...).
Titre du document
Long-term outcome of oesophageal atresia in adolescence (TransEAsome): a national French cohort study protocol
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